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PacBio の Iso-Seq

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PacBio の Iso-Seq
Novogene での PacBio Sequel システム
転写産物アイソフォームの多様なランドスケープを正確に特徴づけることはゲノムの機能生物学を理解する鍵となる情報を生成しますが、全長転写産物をつくることは至難の業でした。アイソフォームシーケンス(Iso-Seq™)は、PacBio SMRT テクノロジーで利用可能な並外れたロングリードに基づいており、アセンブリの必要なしで polyA-tail から 5′ 末端まで転写産物アイソフォーム全体にわたる全長リードを提供します。Iso-Seq は、参照ゲノムなしの種で短いあるいは不完全な転写産物を補足するだけでなく、参照ゲノムのアノテーションを改善し、遺伝子アイソフォーム、選択的スプライシング、遺伝子融合イベントを特徴づけることにおいて理想的です。

世界最大のイルミナと SMRT シーケンス能力を駆使することで、Novogene はイルミナと PacBio Sequel プラットフォームを組み合わせた全長転写産物のシーケンスに関する包括的なソリューションを提供しています。イルミナのショートリードはさらに Sequel から生成される全長転写産物にマッピングされ、エラー修正やより正確な定量化解析を行います。Novogene の経験豊かなバイオインフォマティクス専門家はお客様と密接に連携することで、参照ゲノムの有無にかかわらず種に関する標準
およびカスタマイズされたデータ解析とすぐに公表できる結果を提供します。

さらに、イルミナベースの mRNAlncRNA、circular RNA、 small RNA のシーケンスサービスも提供しています。 詳細はお問い合わせください

Novogene の強み

  • 経験が豊富:Novogene は、これまでの 7,600 件を超えるプロジェクトで、100,000 件を超える検体でシーケンスを実施し、さらに様々な種にわたるトランスクリプトームシーケンスの結果の論文発表してきました。
  • シーケンスの最大能力:Novogene は、世界最大級のイルミナと PacBio シーケンスによって、高品質のデータ、迅速な納期、低価格を提供することができます。
  • 総合的なデータ解析:Novogene は、新しい転写産物、差次的発現、機能アノテーションを発見するために、広く普及している主流ソフトウェアと安定した社内パイプラインを使用しています

プロジェクトのワークフロー


シーケンス条件

  • 3 つのライブラリ:1-2K、2-3K、3-6K、あるいは対象の種に従ってカスタマイズ
  • PacBio Sequel システム

データ品質保証

  • プロジェクトデザインに基づいて、5G、10G または 20G のデータパッケージが保証されます

サンプル条件

  • 総 RNA 量:≥ 10 μg; RNA 濃度:≥ 200 ng/μl
  • RIN 値 ≥ 8.0
  • OD260/280 ≥ 1.8、OD260/230 ≥ 1.8(分解または DNA のコンタミがないこと)

納期

  • 検体の質を確認後 12 営業日以内(データ解析あり)

解析パイプライン


トランスクリプトームの解析パイプライン