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de novo シーケンス

de novoシーケンスは、参照ゲノムがない状態で、特定の生物の最初のゲノム配列を読むことです。動物、植物、微生物の研究において、系統研究、種の多様性解析、遺伝マーカー、その他のゲノム研究に利用されます。

Technology

シーケンスプラットフォーム

  • ILLUMINA

    NovaSeq 6000

    システム仕様:

    80Gb-6Tb範囲の出力 1回のランあたり1.6-40Bペアエンドリード PE150, PE250, PE50対応

  • ILLUMINA

    HiSeq X

    システム仕様:

    16-18Tb範囲の出力 1回のランあたり5.3-6.Bリード リード長最大2x150bp

  • PACBIO

    PacBio Revio System

    システム仕様:

    N50>15Kb,塩基≧Q30の精度90%、SMRTセルあたり 90Gb HiFi収量、ランあたり360Gb HiFi収量、24時間 ランタイムなど

  • PACBIO

    PacBio Sequel II/IIe System

    システム仕様:

    N50>15Kb, 25Kbまでのリード長(CSS), >99.999%(QV50)一致精度, 高GC/繰返し領域へのカバ レッジ, PacBio Sequel IIeのみHiFiリード対応

  • NANOPORE

    Nanopore PromethION

    システム仕様:

    2Mbまでの超ロングリード長, 大型ゲノム高収率, REAL リアルタイム及び柔軟な予算対応