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メタゲノムシーケンス

メタゲノミクスは、オリジナルの生息地にある微生物群をで研究するもので、これらの群内の相互作用について包括的な洞察を与えることができます。また、メタゲノミクスは、微生物の生息地における個々の種を特定することにも役立ちます。ショットガンメタゲノミクスとは、環境サンプルから抽出したDNAを切断し、その小さな断片をシーケンスして、微生物の種構成だけでなく、その遺伝子機能や代謝経路も研究するアプローチを指します。16S/18S/ITS アンプリコンベースのシーケンスは、特定の標的領域であるアンプリコンの配列決定に焦点を当て、コミュニティ内の種構成や多様性を理解するためのDNAシーケンス法です。

  • ILLUMINA

    NovaSeq 6000

    システム仕様:

    80Gb-6Tb範囲の出力 1回のランあたり1.6-40Bペアエンドリード PE150, PE250, PE50対応

  • PACBIO

    PacBio Sequel II/IIe System

    システム仕様:

    N50>15Kb, 25Kbまでのリード長(CSS), >99.999%(QV50)一致精度, 高GC/繰返し領域へのカバ レッジ, PacBio Sequel IIeのみHiFiリード対応