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Technology: Platform

Lab Platform

ノボジーンは、米国カリフォルニア大学デイビス校、中国、シンガポール、英国にゲノムシーケンスラボを有し、その総面積は、2,000m2のGMP施設と2,000m2の臨床ラボを含む20,000m2近くに及びます。2023年現在、ノボジーンは全世界に6つのラボ施設を設立し、約7,000人の世界的な専門家と協力し、世界中のラボで年間200万以上のサンプルのシーケンスを行っています。

UC Davisにあるノボジーンアメリカ・シーケンスセンターは、2016年に設立されました。現在、NovaSeq 6000およびNovaSeq X Plusシーケンスプラットフォームを備え、南北アメリカの基礎および臨床研究のお客様に、NGSサービスとデータ解析を提供しています。

ノボジーンケンブリッジ・ゲノムシーケンスセンターは2018年5月に設立され、2019年8月にケンブリッジ・サイエンスパークに移転しました。同センターは現在、自動ワークステーション、複数のNovaSeq 6000sシーケンスプラットフォーム、高性能コンピューティングクラスターを備え、GCLP認証を取得しています。2023年3月には、NovaSeq X Plusシステムが導入されました。

AITbiotechおよびシンガポールゲノム研究所(GIS)との提携により、ノボジーンAITゲミクスはアジア太平洋地域で最大級のNGSラボを設立しました。2017年以来、シンガポールのバイオポリスにある当社の最先端ラボには、Illumina NovaSeq 6000を6ユニット、PacBio Sequel IIeを1ユニット、10x Genomics Chromium Controller、Olink次世代プロテオミクスプラットフォームを備えています。これらのリソースにより、アジア太平洋、中東、アフリカ(AMEA)地域のお客様に、信頼性が高く、費用対効果の高いサービスを提供しています。

中国では、Illumina NovaSeq 6000およびNovaSeqX Plus、Oxford Nanopore、PacBio RevioおよびSequel IIシステムなど、世界をリードするサプライヤーの最も効率的なテクノロジーを用いています。現在、天津メディカルラボではCAP認証を取得しており、このグローバルクラスの施設では、高品質の臨床シーケンスサービスを全世界に提供することができます。

Sequencing Platform

ILLUMINA

 

ILLUMINA NOVASEQ PLATFORM

 

NovaSeq 6000

 

  • With the NovaSeq, we are able to sequence up to 48 human whole genomes and produce 6Tb of
    data per single run as short as 40 hours.
  • 850G raw data per lane, 3.4T raw data per Flowcell, and 2 x 150 bp read length;
  • 800M raw reads per Flowcell and 2 x 250 bp & 2 x 50 bp reads length;

ILLUMINA NOVASEQ PLATFORM

 

NovaSeq X Plus

 

  • With the NovaSeq X Plus 10B flow cell, we can sequence up to 64 human genomes with 90Gb as short as 24 hours.
  • 375G raw data per lane, ~3T raw data per Flowcell, and 2 x 150 bp read length.

PACBIO

 

PACBIO REVIO PLATFORM

 

  • The Revio system adds affordability, high throughput, and ease of use to a foundation of long reads, exceptional accuracy, and direct methylation detection.
  • The Revio system with a 15x increase in throughput over the Sequel II system. The Revio system can provide exceptional accuracy with 90% of bases ≥Q30 and median read accuracy ≥Q30. With a high-density, 25 million ZMW SMRT Cell, up to 4 SMRT Cells in parallel and 24-hour run times, the Revio system delivers 360 Gb of HiFi reads per day.

PACBIO SEQUEL II/IIE PLATFORM

 

  • The PacBio Sequel II/IIe platforms can generate longer reads with the high performance of
    consensus accuracy and coverage.
  • With direct access to HiFi reads, the PacBio Sequel IIe platform requires less time on data
    processing and analysis, and even reduces ~90% in data storage.
  • By introducing 10 PacBio Sequel IIe platforms, Novogene further enhances the long-read
    sequencing capacity in the world.

10X GENOMICS

 

CHROMIUM CONTROLLER PLATFORM

 

  • The Chromium Controller platform, powered by Next GEM technology, enables integrated analysis
    of single cells at a massive scale.
  • The key to this technology is the ability to use advanced microfluidics to generate tens of
    thousands of single-cell partitions, each containing an identifying barcode for downstream
    analysis in a matter of minutes.

NANOPORE

 

NANOPORE PromethION PLATFORM

 

  • Oxford Nanopore Technologies offers real-time, long-read, direct, and large-scale sequencing
    of DNA or RNA.
  • The PromethION system sequences DNA or RNA by Nanopore reader proteins embedded in an
    electrically resistant membrane.
  • Ultra-long reads span repeat regions in complicated genomes easily and enhance the accuracy
    of genome assembly and large structural variation detection enormously.

Computing Platform

当社のスーパーコンピューターのキャパシティは、毎月280,000の全ヒトゲノムを解析することできます。この機能は、比類のないNGSのキャパシティと連動しており、さまざまなサイズの多くのプロジェクトを実行しながら、データをタイムリーに顧客に提供できます。当社の最先端プラットフォームは、総メモリ量が410 TB、計算能力が最大1,727 Tフロップ、62 PBのIsilonストレージ容量を要したDELLコンピューティングノードで構成されています。私たちのストレージ容量は、ニーズの拡大に応じて拡張でき、お客様のデータがバックアップされ、必要に応じて利用できるようになります。