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Technology: Platform

Lab Platform

Novogeneは、アメリカのカリフォルニア大学デイビス校、中国、シンガポール、イギリス(ケンブリッジ)にゲノムシーケンシングラボを所有しており、2,000㎡のGMP施設と2,000㎡の臨床研究所を含む総面積は約20,000㎡です。

UC Davis ラボは、2016年の初めにオープンし、NovaSeq 6000、HiSeq X Ten、およびHiSeq 4000シーケンスプラットフォームを利用して、南北アメリカの顧客にサービスを提供しています。

研究目的での次世代シーケンシングサービスおよびヒト、植物、動物サンプルの分析。

Novogeneは、中国の天津にCAP認定医療研究所を設立しました。この世界クラスの施設により、高品質の臨床シーケンスサービスをグローバルに提供できます。天津研究所は、NovogeneのデジタルPCRプラットフォームを使用して、液体生検サンプルをテストできます。 NovogeneはAITbiotechと提携して、シンガポールにゲノミクスセンターを立ち上げ、アジア太平洋、中東、アフリカ(AMEA)地域でNGSサービスを提供しています。

Sequencing Platform

ILLUMINA


ILLUMINA NOVASEQ PLATFORM


NovaSeq 6000


  • With the NovaSeq, we are able to sequence up to 48 human whole genomes and produce 6Tb of data per single run as short as 40 hours.
  • 850G raw data per lane, 3.4T raw data per Flowcell, and 2 x 150 bp read length;
  • 800M raw reads per Flowcell and 2 x 250 bp & 2 x 50 bp reads length;

ILLUMINA HISEQ PLATFORM


HiSeq 4000 / 2500 / 2000


  • Novogene is equipped with Hiseq 4000/2500/2000 in different applications: Exome Sequencing, Whole Genome Sequencing, Transcriptome sequencing Metagenomics sequencing, etc.
  • Up to 1200 Gb output range, up to 6B reads per run, and 2 x 50 bp, 2 x 100 bp, 2 x 150 bp, and 2 x 250 bp read length

ILLUMINA HISEQ PLATFORM


HiSeq X Ten


  • Equipped with the powerful Illumina HiSeq X systems, Novogene is capable of sequencing up to 54,000 human genomes per year.
  • System specifications: 1.6 – 1.8 Tb output range, 5.3 – 6 B reads per run, and 2 x150 bp max read length

PACBIO



PACBIO SEQUEL PLATFORM


  • The PacBio Sequel System provides 7x more throughput, more scalability, and lower sequencing costs than the PacBio RS II System while maintaining the same benefits.
  • With the addition of the PacBio Sequel Systems that Novogene acquired in early 2017, Novogene now has the world’s largest SMRT sequencing capacity.

PACBIO SEQUEL II/IIE PLATFORM


  • The PacBio Sequel II/IIe platforms can generate longer reads with the high performance of consensus accuracy and coverage.
  • With direct access to HiFi reads, the PacBio Sequel IIe platform requires less time on data processing and analysis, and even reduces ~90% in data storage.
  • By introducing 10 PacBio Sequel IIe platforms, Novogene further enhances the long-read sequencing capacity in the world.

10X GENOMICS


CHROMIUM CONTROLLER PLATFORM


  • The Chromium Controller platform, powered by Next GEM technology, enables integrated analysis of single cells at a massive scale.
  • The key to this technology is the ability to use advanced microfluidics to generate tens of thousands of single-cell partitions, each containing an identifying barcode for downstream analysis in a matter of minutes.

NANOPORE


NANOPORE PromethION PLATFORM


  • Oxford Nanopore Technologies offers real-time, long-read, direct, and large-scale sequencing of DNA or RNA.
  • The PromethION system sequences DNA or RNA by Nanopore reader proteins embedded in an electrically resistant membrane.
  • Ultra-long reads span repeat regions in complicated genomes easily and enhance the accuracy of genome assembly and large structural variation detection enormously.

Computing Platform

当社のスーパーコンピューターのキャパシティは、毎月280,000の全ヒトゲノムを解析することできます。この機能は、比類のないNGSのキャパシティと連動しており、さまざまなサイズの多くのプロジェクトを実行しながら、データをタイムリーに顧客に提供できます。当社の最先端プラットフォームは、総メモリ量が410 TB、計算能力が最大1,727 Tフロップ、62 PBのIsilonストレージ容量を要したDELLコンピューティングノードで構成されています。私たちのストレージ容量は、ニーズの拡大に応じて拡張でき、お客様のデータがバックアップされ、必要に応じて利用できるようになります。